Lopšelis-darželis “Vyturėlis” ugdymo procesą organizuoja vadovaudamasis švietimo ir mokslo ministerijos patvirtinta ikimokyklinio ugdymo programa “Gairės: programa tėvams ir pedagogams”, „Bendrąja priešmokyklinio ugdymo ir ugdymosi programa“, „Priešmokyklinio ugdymo(si) standartu“, „Ankstyvojo ugdymo vadovu“ ir pagrindiniais (pilietiškumo, humaniškumo, demokratiškumo, atsinaujinimo) ugdymo principais.

Įstaiga dalyvauja Vilniaus kolegijos Pedagogikos fakulteto Pedagoginių studijų kaitos centro  veikloje ir taiko projektų metodą ugdymo procese. Į bendrąjį ugdymo procesą integruoja sveikatos ugdymo ir stiprinimo programą “Sveika gyvensena - nuo mažens”, patvirtintą PPRC. Mokytojai – Respublikinės ikimokyklinių įstaigų darbuotojų asociacijos “Sveikatos želmenėliai” nariai. Lopšelis-darželis “Vyturėlis” – Tarptautinės vaikų ugdymo organizacijos OMEP dalyvis. Ugdymo procese taikoma Lietuvos švietimo plėtotės centro programa “Jaunoji Europa” (“Zipio draugai”).